Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
JMJD1CQ15652 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms