Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIP13Q15645 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms