Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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LAPTM4AQ15012 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LAPTM4AQ15012 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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