Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM25Q14258 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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