Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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