Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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RPA4Q13156 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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