Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TROQ12816 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TROQ12816 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TROQ12816 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TROQ12816 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TROQ12816 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TROQ12816 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
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