Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms