Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms