Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms