Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms