Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL1Q00532 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms