Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHC1P78364 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms