Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VBP1P61758 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VBP1P61758 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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VBP1P61758 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VBP1P61758 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VBP1P61758 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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