Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ACTBP60709 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ACTBP60709 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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