Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP4P57723 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms