Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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