Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTBP49356 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTBP49356 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTBP49356 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTBP49356 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms