Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NESP48681 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NESP48681 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NESP48681 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NESP48681 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NESP48681 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NESP48681 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms