Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms