Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMPK1P30085 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms