Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD38P28907 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD38P28907 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD38P28907 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms