Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSFA2P28290 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms