Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA3P26006 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA3P26006 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA3P26006 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms