Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LMO1P25800 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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