Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2AP24928 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms