Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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