Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRHP20396 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRHP20396 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRHP20396 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRHP20396 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRHP20396 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRHP20396 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRHP20396 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms