Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms