Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMC1P11047 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMC1P11047 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms