Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKAP2O75563 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SKAP2O75563 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms