Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNMO15061 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNMO15061 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNMO15061 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms