Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PDZK1P1A8MUH7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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