Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP5A6NIR3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP5A6NIR3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms