Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00312Q9Y6C7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms