Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PADI1Q9ULC6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PADI1Q9ULC6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms