Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms