Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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COPS7AQ9UBW8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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