Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
MIS18AQ9NYP9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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