Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms