Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms