Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TREX2Q9BQ50 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms