Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID3AQ99856 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID3AQ99856 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID3AQ99856 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID3AQ99856 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID3AQ99856 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID3AQ99856 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms