Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FGD4Q96M96 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms