Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MVB12AQ96EY5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms