Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms