Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYTL4Q96C24 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms