Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PHF3Q92576 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PHF3Q92576 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PHF3Q92576 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PHF3Q92576 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PHF3Q92576 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF3Q92576 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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