Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEST4Q8NFU0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms