Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CBLN3Q6UW01 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CBLN3Q6UW01 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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